潭综合实验区医院前身系 平潭基督教医院 ，创办于1931年。1956年更名为平潭县医院，1960年由政府拨款征地，在右营沙浦筹建新院址，1971年先后迁入新址。2015年9月更名为平潭综合实验区医院。2018年9月，平潭综合实验区医院成建制划归协和医院平潭分院，两院区融合运营,福建医科大学附属协和医院平潭分院（新院区）占地面积约180亩，总建筑面积约23.39万㎡，其中一期建筑面积15万㎡。平潭综合实验区医院原址为老院区，老院区占地面积33亩，建筑面积3.26万㎡。